Управни одбор Астрономске опсерваторије састављен је од седам чланова које именује Влада Републике Србије, од чега су четири члана представници Владе, а три члана предлаже Научно веће Опсерваторије из редова истраживача запослених на Опсерваторији.
Председника Управног одбора бира Влада из редова својих представника, а заменик се по правилу бира из чланова који представљају Научно веће Опсерваторије.
Управни одбор усваја Статут Обсерваторије уз сагласност министарства надлежног за науку. Поред усвајања опших правила и доношења одлука о раду Опсерваторије, Управни одбор спроводи различите активности повезане са планирањем и програмом рада, управљањем ресурсима и имовином, одлукама о реализацији и заштити права, обавезама и одговорностима запослених. Такође врши и друге функције и задатке у складу са Статутом и општим правилницима Опсерваторије.
Чланови Управног одбора
- проф. др Дејан Урошевић, Математички факултет, председник
- проф. др Бојан Арбутина, Математички факултет
- др Антун Балаж, Институт за физику
- проф. др Срђан Буквић, Физички факултет
- др Бранислав Вукотић, Астрономска опсерваторија
- др Марко Сталевски, Астрономска опсерваторија
- др Милан Ћирковић, Астрономска опсерваторија